Garde alternée sans jugement problème inscription scolaire

Mon conjoint et moi sommes séparés ( ni pacs ni mariage) et avons mis en place une garde alternée sans passer par un JAF, puisque nous nous entendons bien et nous arrangeons entre nous. L'école me dit que faute de jugement elle ne peut pas prendre en compte la garde alternée et considéré qu'il n'est que chez un des deux parents. Est-ce vrai? Existe-t-il une loi pour les forcer à prendre en compte?